Sekte Ganapatya adalah kelompok aliran yang memuja Dewa Ganesa.
Keberadaan sekte ini di Bali terbukti dengan banyaknya didapatkan arca Ganesa, baik dalam wujud besar maupun kecil.
Ada dibuat dari batu padas maupun logam, tersimpan dalam beberapa pura di Bali.
Fungsi arca Ganesa sebagai Wigna, penghalang gangguan.
Karenanya, patung Ganesa diletakkan pada tempat-tempat yang dianggap bahaya (angker). Ada caru dengan nama sama.
Dikutip dari salah satu komentar di forum diskusi jaringan hindu nusantara yang kemudian sekte ini dipersatukan oleh Mpu Kuturan pada waktu pemerintahan Raja Udayana.